O Hospital Santa Paula atende a uma grande variedade de especialidades, oferecidas através de diversos médicos distribuídos entre os setores da instituição. São elas:
- Anatomia Patológica
- Anestesiologia
- Angiologia/Cirurgia Vascular
- Cardiologia
- Cardiologia Intervencionista
- Cirurgia Buco Maxilo Facial
- Cirurgia Cardíaca
- Cirurgia de Cabeça e Pescoço
- Cirurgia do Aparelho Digestivo
- Cirurgia Geral
- Cirurgia Oncológia
- Cirurgia Plástica
- Clínica Geral
- Clínica Médica
- Coloproctologia
- Endocrinologia
- Gastroenterologia
- Geriatria
- Hematologia
- Infectologia
- Mastologia
- Medicina Nuclear
- Nefrologia
- Neuro Cirurgia
- Neurologia Clínica
- Oncologia Clínica
- ORL – Otorrinolaringologista
- Ortopedia/Traumologia
- Pneumologia
- Radiologia
- Radioterapia
- Reumatologia
- Urologia
Dentre estas, podemos destacar os serviços de Cardiologia, Neurologia, Ortopedia e Oncologia, no qual o Hospital conta com uma infra-estrutura especializada para atender intercorrências e faz com que a instituição seja uma referência no tratamento destas patologias.